第 1 條
本規程依據金門縣政府組織自治條例第十三條規定訂定之。
第 2 條
金門縣動植物防疫所（以下簡稱本所）置所長，綜理所務，並指揮監督所屬員工。
第 3 條
本所設下列各課，分別掌理有關事項：
一、第一課：動物疾病防疫、檢驗、診斷、衛生保健、流行病學調查、死亡畜禽去化、動物輸出入檢疫追蹤、生鮮肉品輸臺檢疫及認證。
二、第二課：動物用藥品管理、獸醫師執業執照登記、動物收容管理、寵物登記管理、動物保護、一般行政及其他不屬各課之事項。
三、第三課：植物病蟲鼠害、重大疫病蟲害之監測、防疫及農作物農藥殘留監測。
第 4 條
本所置秘書、課長、技士、課員、技佐。
前項辦理動物防疫業務之課長、技士、技佐均由具有獸醫師資格者任之。
第 5 條
本所置人事管理員，由金門縣政府人事處派員兼任，依法辦理人事管理事項。
第 6 條
本所置會計員，由金門縣政府主計處派員兼任，依法辦理歲計、會計及統計事項。
第 7 條
本所政風業務，由金門縣政府政風處派員兼辦。
第 8 條
本規程所列各職稱之官等職等及員額，另以編制表定之。
各職稱之官等職等，依職務列等表之規定。
第 9 條
本所分層負責明細表由本所擬訂，報請金門縣政府核定之。
第 10 條
本規程施行日期，由金門縣政府另定之。